主演：大塚明夫 克莱顿·华生 帕梅拉·阿德龙 海蒂·布雷斯 特伦斯·卡森 美琳达·克拉克 奥利薇亚·阿波 戴恩·A·戴维斯 威廉·R·迪恩
导演：钟彼得 安德鲁·R·琼斯 川尻善昭 小池健 前田真宏 森本晃司 渡边信一郎
简介：《黑客帝国动画版》是由9个不同风格的动画短片组成的电影，故事都发生在《黑客帝国》的世界里。这些短片由日本、美国、韩国的动画高手一起制作。
《机器复兴》讲机器人受不了人类的虐待，最后反抗并把人类当成电池用。《少年故事》里一个男孩突然收到网络的神秘信息，结果被一群黑衣人追捕。《虚拟程序》展示一对男女在虚拟训练中的片段。《世界纪录》说一个短跑运动员快打破人类极限时，被系统强行控制。《超越极限》里因为系统出错，街上突然出现一个奇怪区域。《侦探故事》讲一个侦探想方设法要逃出系统的控制。《矩阵化》说人类抓到一个机器人并把它驯服。《终极战役》记录一艘飞船怎么被毁灭的。
每个短片角度不同，但都讲人和机器对抗的故事。有的机器人反抗人类，有的人类想摆脱机器控制，各种精彩剧情轮番上演。